Negi est un garçon de 10 ans, qui étudie depuis 7 ans dans une école de magie écossaise, dans le but de devenir maître magicien. Mais pour achever sa formation, il doit passer une dernière épreuve, qui l'emmène très loin de chez lui, au Japon! Il devra enseigner l'anglais, pendant un trimestre, à une classe de 31 filles, au lycée Mahora, dont certaines ayant un caractère très affirmé... A son arrivée au Japon, Negi est très étonné par l'ambiance survoltée, et dans la cohue générale il fait connaissance avec Asuna Kagurazaka et Konoka Konoe. Il surprend la conversation des deux jeunes filles tournant autour du professeur Takahata, dont Asuna est secrètement amoureuse. Negi s'intéresse à cette situation, mais ce n'est pas du goût de cette dernière, qui s'en prend violement à lui, ne sachant pas encore qu'il est son nouveau professeur d'anglais. Ce qu'elle apprend peu de temps après, lorsque le fameux Takahata-sensei reconnait Negi, qui avoue alors devoir assumer cette fonction. Et c'est ainsi que les ennuis commencent...
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